專業學院

• 獸醫專業學院
  • 獸醫學系
  • 臨床動物醫學研究所
  • 分子暨比較病理生物學研究所

系所

• 農藝學系
• 生物環境系統工程學系
• 農業化學系
• 森林環境暨資源學系
• 動物科學技術學系
• 農業經濟學系
• 園藝暨景觀學系
• 生物產業傳播暨發展學系
• 生物機電工程學系
• 昆蟲學系
• 植物病理與微生物學系
• 食品科技研究所
• 生物科技研究所
• 植物醫學碩士學位學程

其他附設機構、研究中心

• 動物醫院
• 人工氣候室
• 農業陳列館
• 農業試驗場
• 實驗林管理處
• 山地實驗農場
• 生農、工學院附設水工試驗所
• 農業推廣委員會
• 生態工程中心
• 生物能源研究中心
• 國際農業教育與學術交流中心
• 智慧農業教學與研究發展中心
• 植物醫學研究中心
• 植物教學醫院
• 共同儀器中心
• 食品與生物分子研究中心
• 國家食品安全教育暨研究中心
• 人畜共通傳染病研究中心
• 農業規劃發展研究中心